根据《卓越工程师教育认证标准（JY/T 0660—2025）》要求，结合学院发展实际和未来战略规划，按照“管理服务支撑、产教融合拓展、科研创新引领”三位一体的思路，学院设置以下12个科室，构建支撑卓越工程师培养的组织架构。
| 序号 | 岗位名称 | 负责人 |
| 1 | 党政办公室 | 王旭 |
| 2 | 团委 | 李珊珊 |
| 3 | 研究生管理办公室 | 刘岩 |
| 4 | 校企合作办公室 | 房占鹏 |
| 5 | 实验实践教学中心 | 陈汇资 |
| 6 | 工程师技术中心 | 涂强 |
| 7 | 智能隧道掘进装备河南省协同创新中心条件保障部 | 崔光珍 |
| 8 | 智能隧道掘进装备河南省协同创新中心办公室 | 陈志君 |
| 9 | 智能隧道掘进装备河南省协同创新中心成果转化部 | 王鹏鹏 |
| 10 | 新能源汽车河南省协同创新中心办公室 | 陈文博 |
| 11 | 新能源汽车河南省协同创新中心成果转化部 | 姚雷 |
| 12 | 新能源汽车河南省协同创新中心条件保障部 | 张帅 |